Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Rpa3Q9CQ71 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Rpa3Q9CQ71 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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