Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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