Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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