Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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