Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Sbp-207ENSMUST00000183252 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm28795-201ENSMUST00000185382 695 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm28611-201ENSMUST00000186429 696 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm28757-201ENSMUST00000186638 696 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm28158-201ENSMUST00000188431 696 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 2210420H20Rik-201ENSMUST00000188435 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm21823-201ENSMUST00000189122 696 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm28275-201ENSMUST00000189795 695 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm28203-201ENSMUST00000190672 695 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm29607-201ENSMUST00000191009 696 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Scgb1b9-ps-201ENSMUST00000191567 266 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm29149-201ENSMUST00000191590 696 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm37904-201ENSMUST00000195591 312 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm36978-201ENSMUST00000195734 696 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Iglc4-201ENSMUST00000197046 314 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm7824-201ENSMUST00000198301 532 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 1700016J18Rik-201ENSMUST00000214172 249 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 AC144949.1-201ENSMUST00000225358 422 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Sbp-201ENSMUST00000024940 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Mroh4-202ENSMUST00000137963 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Serpina3f-202ENSMUST00000121337 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm6733-201ENSMUST00000118302 1920 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 AC154314.1-201ENSMUST00000223995 2996 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm29055-201ENSMUST00000186337 1710 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Spin2c-201ENSMUST00000049999 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Rufy3-207ENSMUST00000199312 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Asph-206ENSMUST00000103004 1762 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm8188-201ENSMUST00000219737 1690 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Wdr59-203ENSMUST00000211981 3618 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Hnf4g-201ENSMUST00000108393 2224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Duxbl1-203ENSMUST00000172667 2209 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 CT025645.1-201ENSMUST00000222760 4322 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Pex5l-205ENSMUST00000108225 3109 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm25803-201ENSMUST00000104419 131 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Snord88c-201ENSMUST00000116853 90 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm14666-201ENSMUST00000121121 843 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm5644-201ENSMUST00000122039 465 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm14210-201ENSMUST00000140949 503 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Cul1-203ENSMUST00000143941 530 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Ang-ps1-201ENSMUST00000162314 436 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Btnl5-ps-202ENSMUST00000173333 461 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm27169-201ENSMUST00000183344 746 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm27406-201ENSMUST00000184881 182 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms