Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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