Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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