Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm9689-201ENSMUST00000210009 428 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PctpP53808 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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PctpP53808 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PctpP53808 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PctpP53808 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PctpP53808 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PctpP53808 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PctpP53808 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PctpP53808 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PctpP53808 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PctpP53808 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PctpP53808 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms