Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms