Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms