Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Chd1P40201 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Specc1l-202ENSMUST00000105421 6632 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Chd1P40201 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Chd1P40201 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Kalrn-204ENSMUST00000114949 3618 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Zfp286-201ENSMUST00000054654 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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