Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprkP35822 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Zfp661-203ENSMUST00000110368 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Thbs1-201ENSMUST00000039559 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprkP35822 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms