Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RxraP28700 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RxraP28700 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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