Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Fam229b-206ENSMUST00000136546 592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm11722-201ENSMUST00000138702 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Tktl1-201ENSMUST00000010127 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Npnt-201ENSMUST00000042729 3601 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Rbmx-201ENSMUST00000098470 3107 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Magi2-215ENSMUST00000208219 3266 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm45515-201ENSMUST00000210796 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Harbi1-205ENSMUST00000142692 3686 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 1600012P17Rik-201ENSMUST00000062159 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 1700024J04Rik-201ENSMUST00000093146 1821 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Pard3b-203ENSMUST00000094906 7676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 B130021K23Rik-201ENSMUST00000205226 2593 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Neurod1-201ENSMUST00000041099 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Cep112-216ENSMUST00000182729 2850 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Prdm15-201ENSMUST00000095849 6346 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm6044-201ENSMUST00000121819 499 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm14170-201ENSMUST00000133751 331 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm26184-201ENSMUST00000157686 131 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm8512-201ENSMUST00000215367 471 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm4800-201ENSMUST00000215776 1266 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC125350.5-201ENSMUST00000226102 517 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Aldh7a1-208ENSMUST00000174518 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Tmem63c-201ENSMUST00000110187 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr1115-203ENSMUST00000214119 2455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm43684-201ENSMUST00000199279 6573 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Mro-201ENSMUST00000119239 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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