Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms