Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm34418-201ENSMUST00000212879 309 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm2721-202ENSMUST00000222652 459 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
P10404 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm24257-201ENSMUST00000104472 131 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 S100a10-203ENSMUST00000170612 477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
P10404 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms