Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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