Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

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Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm12098-201ENSMUST00000118277 508 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Ly6a-202ENSMUST00000186526 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Pacsin2-202ENSMUST00000165095 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Rps6ka1-206ENSMUST00000168974 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Zfp148-201ENSMUST00000089677 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 D3Ertd751e-207ENSMUST00000146165 3574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 CT009723.1-201ENSMUST00000215057 1803 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 AC093043.2-201ENSMUST00000228616 2017 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Phc1-201ENSMUST00000079560 3839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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