Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Rnf4Q9QZS2 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Rnf4Q9QZS2 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Rnf4Q9QZS2 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Rnf4Q9QZS2 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Rnf4Q9QZS2 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Rnf4Q9QZS2 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Rnf4Q9QZS2 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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Rnf4Q9QZS2 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Rnf4Q9QZS2 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Rnf4Q9QZS2 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Rnf4Q9QZS2 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Rnf4Q9QZS2 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Rnf4Q9QZS2 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Rnf4Q9QZS2 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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