Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Eif4a2-202ENSMUST00000077605 2708 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm45237-202ENSMUST00000211157 2452 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm17027-201ENSMUST00000171202 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm11901-201ENSMUST00000120412 437 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm16159-201ENSMUST00000126122 947 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm18301-201ENSMUST00000185261 888 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm43837-201ENSMUST00000200306 668 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm9689-201ENSMUST00000210009 428 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps91-201ENSMUST00000213039 784 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC159263.2-201ENSMUST00000221593 411 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm38110-201ENSMUST00000194594 1551 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm7682-202ENSMUST00000202916 1582 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Spef2-205ENSMUST00000162780 1639 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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