Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp29Q9ES63 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp29Q9ES63 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp29Q9ES63 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp29Q9ES63 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp29Q9ES63 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp29Q9ES63 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp29Q9ES63 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp29Q9ES63 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp29Q9ES63 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp29Q9ES63 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp29Q9ES63 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms