Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnft1Q9DCN7 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms