Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Polr3f-201ENSMUST00000028914 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf17Q99MV7 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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