Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 1700009J07Rik-201ENSMUST00000178996 912 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Mark4-ps-201ENSMUST00000196140 384 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Ighv8-16-201ENSMUST00000199258 294 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm7384-201ENSMUST00000203682 530 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm32567-201ENSMUST00000211244 682 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 4933407I05Rik-201ENSMUST00000213311 482 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm7695-201ENSMUST00000220900 641 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 AC159312.1-201ENSMUST00000221508 856 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 AC165157.2-201ENSMUST00000222265 367 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Krtap7-1-201ENSMUST00000056118 620 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Snora65-201ENSMUST00000083190 130 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SmagpQ99KC7 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SmagpQ99KC7 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SmagpQ99KC7 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SmagpQ99KC7 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SmagpQ99KC7 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SmagpQ99KC7 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SmagpQ99KC7 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SmagpQ99KC7 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SmagpQ99KC7 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SmagpQ99KC7 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SmagpQ99KC7 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SmagpQ99KC7 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SmagpQ99KC7 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SmagpQ99KC7 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SmagpQ99KC7 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SmagpQ99KC7 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms