Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Thbs1-201ENSMUST00000039559 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Adgrl3-208ENSMUST00000118442 5101 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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