Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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