Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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