Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm27197-201ENSMUST00000184325 479 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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