Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.8 ms