Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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Q3U6N9 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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Q3U6N9 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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Q3U6N9 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Q3U6N9 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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