Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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