Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rps29P62274 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rps29P62274 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms