Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Snora65-201ENSMUST00000083190 130 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Tead1-206ENSMUST00000164363 1495 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Calr4-203ENSMUST00000106629 1583 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VdrP48281 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm17027-201ENSMUST00000171202 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 Pramef6-201ENSMUST00000081645 1487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm26209-201ENSMUST00000103852 110 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm13576-201ENSMUST00000120851 778 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm11722-201ENSMUST00000138702 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm19402-201ENSMUST00000180297 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
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VdrP48281 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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VdrP48281 Snora74a-201ENSMUST00000083715 196 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Paip1-202ENSMUST00000109203 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
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VdrP48281 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm29081-203ENSMUST00000190140 1500 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Psg19-201ENSMUST00000004657 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Magea5-201ENSMUST00000069556 1360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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