Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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PtprmP28828 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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