Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Tdpoz1-202ENSMUST00000181541 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Runx1-207ENSMUST00000189679 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Tmem63c-201ENSMUST00000110187 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Tex9-201ENSMUST00000085358 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Dsg3-201ENSMUST00000070892 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm22268-201ENSMUST00000104009 131 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm25232-201ENSMUST00000104502 132 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Slco2b1-203ENSMUST00000107088 4369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Sat2-202ENSMUST00000108656 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Kbtbd4-202ENSMUST00000111464 2343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm15066-201ENSMUST00000120163 2608 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Tfrc-202ENSMUST00000120680 1860 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm12970-201ENSMUST00000134911 581 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Bnip1-206ENSMUST00000135824 629 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm12930-201ENSMUST00000146679 676 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 4930562A09Rik-201ENSMUST00000153818 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm26633-201ENSMUST00000180546 3256 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 1190005I06Rik-203ENSMUST00000180677 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Mrgprc7-ps-201ENSMUST00000187169 952 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm37314-201ENSMUST00000193545 2685 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Cnih4-205ENSMUST00000193907 531 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gabra4-203ENSMUST00000198138 440 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm43782-201ENSMUST00000202790 229 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm18840-201ENSMUST00000204553 506 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Nxpe1-ps-202ENSMUST00000210160 956 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm4739-201ENSMUST00000218296 633 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 CT009757.2-201ENSMUST00000220806 2028 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 AC159312.1-201ENSMUST00000221508 856 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 AC102431.2-201ENSMUST00000224071 2448 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Ebf2-201ENSMUST00000022637 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 AC132467.1-201ENSMUST00000226498 1845 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 C6-201ENSMUST00000022788 2447 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Borcs8-201ENSMUST00000002418 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Tmem174-201ENSMUST00000050389 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Idh3g-201ENSMUST00000052761 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Pabpc6-201ENSMUST00000057190 3208 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gabrb2-201ENSMUST00000007797 3989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd3P09027 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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