Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ifnb1P01575 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms