Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm37108-201ENSMUST00000194605 626 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm2939-201ENSMUST00000198496 478 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Dppa5b-201ENSMUST00000214261 348 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Dppa5c-201ENSMUST00000216268 348 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC132468.1-201ENSMUST00000224706 499 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Olfr1270-201ENSMUST00000099754 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Aph1b-202ENSMUST00000113730 682 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm11220-201ENSMUST00000118844 475 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC116596.2-201ENSMUST00000226642 526 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms