Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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