Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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