Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Rabgef1Q9JM13 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Rabgef1Q9JM13 Slitrk2-201ENSMUST00000036043 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Hdhd2-209ENSMUST00000150990 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ms4a6d-201ENSMUST00000025582 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Hpd-201ENSMUST00000031398 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Rabgef1Q9JM13 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Rabgef1Q9JM13 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
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Rabgef1Q9JM13 4833417C18Rik-201ENSMUST00000146868 1269 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Rabgef1Q9JM13 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Rabgef1Q9JM13 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Rabgef1Q9JM13 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Pramef6-201ENSMUST00000081645 1487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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