Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Lrrc15-201ENSMUST00000064606 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rnf17Q99MV7 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rnf17Q99MV7 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rnf17Q99MV7 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rnf17Q99MV7 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rnf17Q99MV7 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rnf17Q99MV7 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rnf17Q99MV7 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rnf17Q99MV7 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf17Q99MV7 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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