Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Cacng5-202ENSMUST00000106742 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm44437-201ENSMUST00000203832 4038 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm42572-201ENSMUST00000202292 3378 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Tcf4-201ENSMUST00000066717 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Tbc1d24-204ENSMUST00000167791 4383 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprtQ99M80 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PtprtQ99M80 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PtprtQ99M80 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PtprtQ99M80 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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