Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc9Q8CDN9 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrc9Q8CDN9 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Adgrl2-204ENSMUST00000195988 4541 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrc9Q8CDN9 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms