Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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