Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Olfr1276-203ENSMUST00000218065 5052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NischQ80TM9 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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