Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc88cQ6VGS5 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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