Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtifQ6PEE2 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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