Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 4930553I04Rik-201ENSMUST00000196722 670 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Bnip1-206ENSMUST00000135824 629 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm8813-201ENSMUST00000155930 595 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC130829.2-201ENSMUST00000222931 127 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm43225-201ENSMUST00000201381 1439 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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