Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spire1Q52KF3 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms