Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms